Whole-genome doubling은 chromatin segregation의 oncogenic loss를 유발한다.
Abstract
Whole-genome doubling (WGD)는 인간 암에서 recurrent event이며 chromosomal instability와 aneuploidies 획득을 촉진한다. 그러나 WGD 세포에서 염색질의 3차원 구조와 oncogenic phenotype에 대한 기여는 현재 알려져 있지 않다.
여기서 우리는 p53-deficient cell에서 WGD가 loss of chromatin segregation (LCS)을 유도한다는 것을 보여준다. 이 사건은 short and long chromosome, A와 B subcompartments 및 인접한 chromatin 도메인 사이의 분리가 감소하는 것이 특징이다. LCS는 tetraploid checkpoint의 활성화를 우회한 세포에서 CTCF와 H3K9me3의 downregulation에 의해 구동된다. Longitudinal analyses에 따르면 LCS는 WGD 세포에서 subcompartment repositioning을 위해 게놈 영역을 기본으로 한다. 이는 WGD 세포에서 유래한 종양에서 oncogene activation과 관련된 chromatin 및 epigenetic 변화를 초래한다. 특히, subcompartment repositioning events는 chromosomal alteration와 크게 무관했는데, 이는 이것들이 tumour development and progression에 기여하는 보완적인 메커니즘이었음을 나타낸다. 전반적으로, LCS는 궁극적으로 oncogenic epigenetic and transcriptional modification을 초래하는 hromatin conformation change를 개시하며, 이는 chromatin evolution이 WGD-driven cancer의 특징임을 시사한다.