Translatome과 transcriptome의 동시 profiling을 통해 human zygotic genome 활성 과정 중 TPRX의 역할을 밝혀내다
Translational regulation은 oocyte-to-embryo transition(OET) 및 zygotic genome activation(ZGA)에서 핵심적인 역할을 합니다. 이 연구에서는 ultra-low-input Ribo-seq와 mRNA-seq를 통합하여 인간 난모세포(human oocytes)와 초기 배아(early embryos)에서 translatome과 transcriptome을 함께 profiling 했습니다. Mouse counterparts로 비교한 결과, epigenetic reprogramming, transposon defense, small RNA biogenesis의 기능을 가지며 넓은 범위에서 각각 별도로 translated된 gene들을 확인했으며, 부분적으로 3′-UTR(Untranslated regions)의 species-specific regulatory elements에 의해 작동되었습니다. 또한, TPRXL, TPRX1, TPRX2를 포함한 PRD-like homeobox transcription factor들은 ZGA를 중심으로 집중적으로 translation됩니다. TPRX 1/2/L knockdown은 ZGA의 결함 및 이식 전 발달(preimplantation development)로 이어집니다. 비정상적으로 발현된 TPRX는 인간 배아줄기세포에서 주요 ZGA 유전자에 binding하고 활성화합니다. 이러한 데이터는 OET 동안 translational landscapes의 conservation 및 divergence에 대해 밝히고, human ZGA의 중요한 regulator들을 식별합니다.