거대 이배체 faba 게놈은 전 세계 단백질 작물의 변이를 밝힙니다
Abstract
현재 육류가 풍부한 식단에서 현지에서 생산되는 식물성 단백질의 비율을 늘리면 온실 가스 배출과 생물 다양성 손실을 크게 줄일 수 있습니다. 그러나 식물성 단백질 생산은 농경학적 가치에서 대두와 동등한 한랭 계절 콩과 식물의 부족으로 인해 방해를 받고 있습니다. Faba 콩 (Vicia faba L.)은 높은 수확 잠재력을 가지고 있으며 온대 지역에서 재배하기에 적합하지만 게놈 자원이 부족합니다.
이 연구에서는 faba 콩 게놈의 고품질 염색체 규모 어셈블리를 보고하고 증폭 속도와 레트로트랜스포존 및 위성 반복 제거 사이의 불균형을 통해 크기가 13 Gb로 확장되었음을 보여줍니다. 유전자 및 재조합 이벤트는 염색체 전체에 고르게 분산되어 있으며 유전자 공간은 게놈 크기를 고려할 때 현저하게 작습니다. 그러나 탠덤 복제로 인해 상당한 복제 수 변화가 있습니다. 게놈 서열의 실제 적용을 입증하면서 표적 유전자형 분석을 개발하고 고해상도 게놈 전체 연관 분석을 사용하여 종자 크기와 고문 색상의 유전적 기초를 해부합니다.
제시된 리소스는 faba 콩을 위한 유전체학 기반 육종 플랫폼을 구성하여 육종가와 유전학자가 지중해, 아열대 및 북부 온대 농생태 지역에서 지속 가능한 단백질 생산의 개선을 가속화할 수 있도록 합니다.