초기 마우스 발달에서 리보솜 점유의 단일 세포 정량화
Abstract
번역 조절은 포유류 초기 배아 발달에 중요합니다. 그러나 이전 연구는 대립유전자 특이적 분석을 포함한 번역 조절의 정확한 결정을 배제하는 벌크 측정만 진행되었습니다. 이 문제를 해결하기 위해 우리는 ITP(Ribo-ITP)를 통한 RIBOsome 프로파일링이라는 새로운 미세유체 동위영동 (ITP) 접근법을 개발했으며 초기 마우스 발달 동안 단일 난모세포와 배아에서 번역을 특징지었습니다.
우리는 중심체 구성 및 RNA의 N6-메틸아데노신 수정과 관련된 유전자를 조절하는 주요 메커니즘으로 차등 번역 효율성을 확인했습니다. 우리의 높은 적용 범위 측정을 통해 우리가 아는 한 초기 발달 과정에서 대립 유전자 특정 리보솜 참여에 대한 첫 번째 분석이 가능했습니다. 이로 인해 접합체 RNA와 리보솜의 단계별 차등 결합이 발견되었고 대립유전자 편향된 발현을 나타내는 전사물의 번역 효율이 감소했습니다. 우리의 측정을 단백질체 데이터와 통합함으로써, 우리는 배아 소포 단계 난모세포의 리보솜 점유가 접합체의 단백질 풍부도를 결정하는 주된 요인임을 발견했습니다. Ribo-ITP 접근 방식은 단일 세포를 포함한 초저 입력 샘플에서 높은 적용 범위 및 고해상도 리보솜 점유 측정을 제공하여 수많은 응용 프로그램을 가능하게 합니다.