UK Biobank의 genetics 및 health의 Plasma proteomic associations.
Abstract
Pharma Proteomics Project는 54,219명의 UK Biobank participants의 plasma proteomic profiles을 특성화하는 precompetitive biopharmaceutical consortium입니다.
여기에서는 기술 및 생물학적 검증, proteomic disease signatures에 대한 인사이트, 다양한 인구통계 및 건강 지표에 대한 예측 모델링을 포함하여 이 initiative에 대한 자세한 요약을 제공합니다. 2,923개 단백질에 대한 포괄적인 protein quantitative trait locus (pQTL) mapping을 통해 14,287개의 주요 genetic associations을 확인했으며, 이 중 81%는 이전에 설명되지 않은 것으로 non-European individuals의 ancestry-specific pQTL mapping과 함께 제시합니다. 이 연구는 시간이 지남에 따라 sample sizes and proteomic assay coverages가 증가함에 따라 예상되는 pQTL 발견율과 맥락을 같이하여 plasma proteome의 genetic architecture에 대한 업데이트된 특성을 제공합니다. 다양한 생물학적 영역에 걸친 trans pQTL에 대한 광범위한 인사이트를 제공하고, 다양한 cytokines 및 complement networks에서 ligand–receptor interactions과 pathway perturbations에 대한 genetic influences을 강조하며, gastrointestinal tissue-enriched expression되는 단백질에 대한 ABO 혈액형 및 FUT2 secretor 상태의 long-range epistatic effects을 설명합니다. 우리는 PCSK9와 같은 protein targets의 genetic proxied effects를 additional endpoints로 확장하고 코로나19 susceptibility와 관련된 loci에서 perturbed된 specific genes and proteins을 밝혀냄으로써 신약 개발을 위한 이러한 데이터의 유용성을 입증했습니다.
이 public–private partnership은 과학계에 상당한 폭과 깊이의 open-access proteomics resource를 제공하여 proteo-genomic discoveries의 기초가 되는 biological mechanisms을 규명하고 바이오마커, 예측 모델 및 치료제 개발을 가속화하는 데 도움을 줍니다.