[Nature Communications] Tissue-specific multi-omics analysis of atrial fibrillation

  심방세동(Atrial Fibrillation; AF)에 대한 Genome-Wide Association Studies(GWAS)는 질병과 관련 변종 다수를 발견했습니다. 그럼에도 불구하고 이들의 근본적인 분자 메커니즘, 특히 mRNA와 단백질 발현에 대한 반응은 거의 이해하기 어려운 수준입니다. 따라서, 기본 분자 네트워크를 해독하기 위해서는 정제된 다중 오믹스 접근법이 필요합니다.

  이 논문에서는 cross-sectional study에서 인간 심방 조직의 genomics, transcriptomics 및 proteomics를 통합하여 transcript(cis-eQTL) 및 protein(cis-pQTL) 발현량 양쪽에 대응하는 유전자 변형의 광범위한 영향을 식별합니다. 이들은 또한 AF ‘core gene’의 후보를 결정하기 위해 polygenic risk scores(다유전자 위험 지수)에 기반한 새로운 표적 trans-QTL 접근법을 확립합니다. 이 접근 방식을 사용하여 AF GWAS hits을 위한 두 가지 trans-eQTLs과 다섯 가지 trans-pQTLs을 식별하고, GWAS SNP rs9481842과 AF 사이의 연결고리로서 transcription factor NKX2-5가 가지는 역할을 설명합니다.

  종합적으로, 이 연구에서는 작은 데이터셋들에서 trans-acting networks을 발견하고 심혈관 질환 유전자 우선 순위 지정을 위한 transcript 및 protein 수준에 대한 심방 조직 별 regulatory variants의 풍부한 리소스를 제공하는 통합 다중 오믹스 기반 방법을 제시합니다.