Stunting는 전 세계적으로 5명 중 1명의 아이들에게 영향을 미치며 더 큰 감염성 이환율, 사망률, 신경 발달 결손과 관련이 있다. 최근의 증거는 초기 장내 미생물이 면역, 대사 및 내분비 경로를 통해 어린이 성장에 영향을 미친다는 것을 시사한다. whole metagenomic sequencing을 사용하여 개선된 water, sanitation and hygiene (WASH)과 infant and young child feeding (IYCF)의 무작위 시험인 Sanitation, Hygiene, Infant Nutrition Efficacy Trial (SHINE; NCT01824940)에 등록된 짐바브웨 시골 지역의 1-18개월 어린이 335명의 gut microbiome assembly을 지도화한다.

여기서 우리는 early-life gut microbiome이 linear growth을 개선하기 위한 무작위 개입에 반응하지 않는 프로그래밍된 조립을 겪는다는 것을 보여준다. 그러나 maternal HIV 감염은 Bifidobacterium 종의 수 감소뿐만 아니라 감염되지 않은 아이들의 early-life gut microbiome의 과도한 다양화와 과도한 성숙과 관련이 있다. machine learning models (XGBoost)을 사용하여 taxonomic microbiome 기능이 어린이 성장을 제대로 예측하지 못하지만 기능적 메타게놈 기능, 특히 B-vitamin 및 nucleotide biosynthesis pathway는 달성된 linear and ponderal growth와 growth velocity를 적당히 예측한다. 유아기의 gut microbiome을 목표로 하는 새로운 접근법은 child undernutrition과 싸우기 위한 노력을 보완할 수 있다.