Pan-cancer single-cell 분석을 통해 종양 미세 환경에서 암 관련 fibroblast의 이질성 및 가소성을 밝혀내다
Cancer-associated fibroblasts(CAFs)는 종양 미세 환경(tumor microenvironment; TME)의 주요 구성 요소이며 암의 hallmark에 영향을 미치지만, 이것이 서로 다른 암 유형에 걸친 공통적인 특성에 대한 체계적인 조사가 되어 있지는 않습니다.
이 논문에서는 10개의 고형암(solid cacer types) 종류에 걸쳐 226개의 샘플에 대해 pan-cancer 분석을 수행함으로써 단일 세포 분해능에서 TME를 프로파일링하여, 서로 다른 종의 CAF 간의 공통점/가소성을 보여줍니다. 주요 CAF 유형의 활성화 궤적은 세 가지 상태로 나뉘며, 다른 세포 구성 요소와 뚜렷한 상호 작용을 나타내며 면역 요법의 예후와 관련이 있습니다. 또한, CAF 구성요소의 작은 부분들은 다른 TME 구성요소(예: endothelia 및 macrophage)의 대안적 기원을 나타냅니다. 특히, 여러 암세포에서 공통적으로 발현되는 endothelial-to-mesenchymal 전이 CAF는 근처에 있는 SPP1+ tumor-associated macrophages와 상호작용 할 수도 있는데, 이러한 CAF는 endothelial-to-mesenchymal 전이 및 생존 계층화에 관여합니다.
해당 연구는 CAF의 공유된 특성과 역학을 포괄적으로 프로파일링하고, 다양한 암 유형에 걸친 이질성과 가소성을 강조합니다.
* 해당 논문에서는 pan-cancer single-cell 정보에 대한 통합 브라우저를 개발하였습니다. (https://gist-fgl.github.io/sc-caf-atlas/)