GWAS and meta-analysis identifies 49 genetic variants underlying critical COVID-19

치명적인 COVID-19은 이전 연구들에서 보인 바와 마찬가지로, 유전적 연관성을 발견하는 데 효율이 높은, 극단적이고 임상적으로 homogeneous한 질병 표현형입니다. 발현 과정에서 질병의 진행 단계에도 불구하고, 연구진들은 COVID-19를 앓고 있는 위독한 환자의 host genetics가 매우 유익한 효과를 가진 면역 조절 치료법을 밝혀낼 수 있다는 것을 보여주었습니다.

이 논문에서는 국제 GenOMICC(11,440건) 연구의 위독한 질병 사례 및 중증 & 치명적인 질병 상태 연구에 집중한 ISARIC4C(676건) 및 SCOLGE 컨소시엄(5,934건)을 통해 마이크로어레이 유전자형과 전체 게놈 시퀀싱 데이터를 조합하여 구성된, 위독한 COVID-19 사례 24,202건을 분석합니다. 이러한 결과를 기존 연구의 맥락에서 설명하기 위해, 연구진들은 이전에 발표된 데이터를 사용하여 새로운 GenOMICC 게놈 전체 연관 연구(GWAS) 결과에 대한 메타 분석을 수행합니다. 이들은 게놈 전체에서 49개의 genome-wide로 유의한 연관성을 발견했고, 그 중 16개는 이전에 보고된 바 없습니다. 이러한 발견의 임상적 의미를 조사하기 위해, 연구진들은 단백질 코딩 변형의 구조적 결과를 추론하고, Mendelian Randomization을 사용한 유전자 및 단백질 발현뿐만 아니라 단핵구 전사체 전체 연관 연구(TWAS; transcriptome-wide association study) 모델을 사용하여 GWAS 결과를 유전자 발현 데이터와 결합합니다.

이들은 염증 신호 전달(JAK1), 단세포-대식세포 활성화 및 내피 투과성(PDE4A), 면역대사(SLC2A5 및 AK5), 바이러스 진입 및 복제에 필요한 숙주 인자(TMPSS2 및 RAB2A)를 포함하여 여러 생물학적 시스템에서 잠재적으로 약물화가 가능한 표적을 식별합니다.