Intratumour heterogeneity (ITH)는 폐암 진화를 촉진하여 면역 회피와 치료에 대한 내성을 유발합니다.

이 연구에서는 한 쌍의 전체 엑솜 및 RNA 시퀀싱 데이터를 사용하여 TRACERx 연구에 전향적으로 모집된 첫 번째 421명의 환자 중 347명의 354개 비소세포 폐암 종양에서 종양 내 전사체 다양성을 조사합니다. 96개의 종양 인접 정상 조직 샘플과 함께 원발성 및 전이성 질환을 나타내는 947개의 종양 영역에 대한 분석은 전사체가 표현형 변이의 주요 원인임을 암시합니다. 유전자 발현 수준과 ITH는 종양 진화 동안 양성 및 음성 선택 패턴과 관련이 있습니다. 우리는 후성 유전학적 기능 장애와 관련된 빈번한 사본 수 독립적 대립 유전자 특정 발현을 관찰합니다. 대립유전자 특이적 발현은 또한 암 유전자 파괴에 수렴하는 게놈-전사체 평행 진화를 초래할 수 있습니다. 우리는 RNA 단일 염기 치환의 서명을 추출하고 그 병인을 RNA 편집 효소인 ADAR과 APOBEC3A의 활동에 연결하여 종양에서 감지되지 않은 진행 중인 APOBEC 활동을 밝힙니다. 원발성-전이성 종양 쌍의 전사체를 특성화하여 게놈과 전사체 변수를 활용하는 여러 기계 학습 접근법을 결합하여 전이 파종 가능성을 돌연변이의 진화 적 맥락과 연결하고 원발성 종양 영역 내에서 증식을 증가시킵니다.

이러한 결과는 ITH, 폐암 진화 및 전이에 영향을 미치는 게놈과 전사체 사이의 상호 작용을 강조합니다.