FinnGen은 well-phenotyped 고립된 집단에서 유전적 통찰력을 제공한다.
Abstract
유해한 allele가 종종 소수의 low-frequency variant (0.1% ≤ minor allele frequency < 5%)에 집중되기 때문에 핀란드와 같은 Population isolate는 유전 연구에 도움이 된다. 이 variant들은 많은 수의 ultrarare variant에 분산되지 않고 초기 병목 현상에서 살아남았다. 이 효과는 멘델 유전학에서 잘 확립되어 있지만, 일반적인 질병 유전학에서 그 가치는 덜 탐구된다.
FinnGen은 50만 명의 핀란드인의 게놈과 국가 건강 등록 자료를 연구하는 것을 목표로 하고 있다. 참가자의 상대적으로 높은 중위 연령(63세)과 병원 기반 모집의 상당 부분을 고려할 때 FinnGen은 질병 엔드 포인트에 대해 풍부하다. 여기서 우리는 FinnGen의 224,737명의 참가자들의 데이터를 분석하고 이전에 대규모 게놈 전체 연관 연구(GWAS)에서 조사된 15가지 질병을 연구한다. 우리는 또한 Estonia와 영국의 바이오뱅크 데이터의 메타 분석을 포함한다. 우리는 핀란드 인구에서 풍부한 주로 low-frequency variant인 30개의 새로운 연관성을 확인했다. 1,932개 질병의 GWAS는 또한 807개(247개)의 end point를 가진 2,496개(771개)의 독립된 위치에서 2,733개의 게놈 전체 유의 연관성(893개의 phenome-wide significant (PWS)), P < 2.6 × 10–11)을 확인했다. 이 중 fine-mapping은 83(42PWS) 엔드 포인트과 관련된 148(73PWS) 코딩 변형을 포함했다. 또한 91(47 PWS)은 비핀란드 유럽인에서 5% 미만의 allele frequency를 보였으며, 이 중 62(32 PWS)는 핀란드에서 2배 이상 농축되었다.
이러한 발견은 low-frequency, high impact variant를 통해 일반적인 질병의 생물학에 진입점을 찾는 병목 현상 인구의 힘을 보여준다.