공학적인 세포 출입 작용을 통해 수용체 생물학과 단일 세포 유전체학을 연결하다
Abstract
세포들은 receptor-ligand 사이의 상호작용을 통해 서로 소통합니다. 이 논문에서는 ligand 단백질을 제시하고 payload를 전달하며 수용체 특이성을 기록하기 위해 engineered receptor-ligand interaction(ENTER)에 의한 lentivirus 매개 세포 내 침투를 설명합니다. 연구진들은 T세포 수용체(TCR)-MHC 펩타이드, 항체-항원 및 다른 receptor-ligand 쌍 사이의 상호 작용을 디코딩하도록 ENTER를 최적화했습니다.
바이러스의 발현 전략을 통해 ENTER가 B 세포 수용체와 항원 사이의 상호작용을 포착할 수 있게 합니다. 이 연구에서는 ENTER를 설계하여 혼합 모집단의 세포 행동을 선택적으로 조절하기 위해 항원 특이적 T 또는 B 세포에 유전적 payload를 전달하도록 했습니다. RNA 시퀀싱에 의한 ENTER의 단일 세포 판독(ENTER-seq)은 항원 특이성, TCR 클론성, 세포 유형 및 개별 T 세포의 상태를 여럿 열거할 수 있게 합니다. CMV 혈청 양성 환자 혈액 샘플의 ENTER-seq는 동일한 epitope를 대상으로 하는 effector memory T 세포 분화와 클론 간 대 클론 내 표현형 다양성을 구동하는 바이러스 epitope를 보여줍니다. ENTER 기술은 수용체 특이성, 세포 운명과의 연결, 항원 특이적 화물 전달을 체계적으로 발견할 수 있게 합니다.