DNA hypomethylation silences anti-tumor immune genes in early prostate cancer and CTCs

암은 종양 발생에 대한 기여가 불확실한, 큰 chromatin domain의 저메틸화 관련 침묵 작용(silencing)의 특징을 지닙니다. 고해상도 genome-wide single-cell DNA methylation sequencing을 통해 전이 순환 종양 세포(CTC)를 통해 전립선 악성 종양의 가장 초기 감지 가능한 단계부터 균일하게 hypomethylated된 40개의 핵심 domain을 식별합니다.

이러한 repressive domain 중에 내포된 것은 침묵 작용을 피하고 세포 증식 유전자의 발현이 풍부해진, 보존된 methylation 상태가 유지되어 있는, 보다 작은 loci입니다. 핵심 hypomethylated domain 내 전사가 억제된 유전자는 면역 관련 유전자에 대해 발현량이 높습니다. 이들 중 두드러진 것은 NKT 세포에 지질 항원을 발현하는 5개의 CD1 유전자와 선천 면역에 관련된 4개의 IFI16 관련 인터페론 유도 유전자를 모두 포함하는 단일 유전자 클러스터입니다. 면역 능력이 있는 mouse에서 CD1 또는 IFI16 murine orthologs의 재발현은 종양 발생을 중단시키고, 항종양 면역의 활성화를 동반합니다.

따라서 초기 후생유전학적 변화는 정의된 염색체 위치 내에 공존하는 유전자를 목표로 종양 발생을 유도할 수 있습니다. Hypomethylated domain은 CTC용으로 농축된 혈액 검체에서 감지할 수 있습니다.