Deconstruction of rheumatoid arthritis synovium defines inflammatory subtypes

류마티스 관절염은 관절의 염증과 파괴를 일으키는 전형적인 자가면역 질환이다. 현재 류마티스 관절염에 대한 치료법은 없으며, 치료의 효과가 환자에 따라 다르다는 점에서 아직 정의되지 않은 병리학적 다양성을 시사한다. 여기서, 이러한 병리학적 이질성을 특징짓는 세포 상태와 pathway를 분석하기 위해, 우리는 류마티스 관절염 환자의 염증이 있는 윤활막에서의 전체 세포 스펙트럼을 분석했다. 우리는 79명의 기증자로부터 얻은 윤활막 조직의 **multimodal single cell RNA-sequencing과 surface protien 데이터 및 이와 연결된 조직학적 데이터를 사용하여 314,000개 이상의 세포를 포함하는 류마티스 관절염 윤활막 조직의 단일 세포 아틀라스를 구축했다. 우리는 조직을 세포 유형의 풍부성에 따라 분류하여 각각 특정한 세포 상태에 의해 구별되는 6개 그룹, 즉 세포 유형 풍부성 표현형(cell-type abundance phenotypes, CTAPs)으로 분류했다. 이 CTAPs는 T-cell 및 B-cell이 풍부한 샘플부터 림프구가 거의 없는 샘플에 이르기까지 류마티스 관절염의 윤활막 염증 다양성을 보여준다. 질병 관련 세포 상태, 사이토카인, risk genes, 조직학 및 혈청학 지표는 특정 CTAPs와 연관되어 있다. CTAPs는 동적이고 치료 반응을 예측할 수 있으며, 이는 류마티스 관절염 윤활막 표현형을 분류하는 것의 임상적 유용성을 강조한다. 이 포괄적인 아틀라스와 류마티스 관절염 윤활막 조직의 분자적, 조직 기반 계층화는 류마티스 관절염 병리학과 이질성에 대한 새로운 통찰력을 제공하며, 새로운 표적 치료법을 개발하는 데 도움이 될 수 있다.

*윤활막(synovium): 관절을 둘러싸고 있는 조직으로, 관절 내부에 윤활액(synovial fluid)을 분비해 관절의 움직임을 원활하게 하고 관절을 보호함.
**multimodal: 두 가지 이상의 데이터 유형을 한 번에 수집하는 분석 기법. 여기서는 single-cell CITE-seq을 사용해 하나의 단일세포로부터 RNA-sequencing 데이터 및 surface protein을 함께 수집하는 것을 의미함.