Drosophila are hosts to the first described parasitoid wasp of adult flies
초파리(Drosophila)는 성체 파리를 기생하는 최초로 보고된 기생말벌(parasitoid wasp)의 숙주입니다. Abstract 기생충과 숙주 간의 진화적 갈등은 생명의 나무에서 관찰되는 가장 특화된 적응 중 일부를 이끄는 중요한 원동력입니다. 곤충들 중에서도 이러한 적응은…
High-resolution genomic history of early medieval Europe
초기 중세 유럽의 고해상도 유전자 역사 Abstract 많은 알려진 및 알려지지 않은 역사적 사건들이 유전 연구의 탐지 한계 아래에 남아 있습니다. 이는 미세한 조상 변화가 재구성하기 어려워서 그렇습니다. 공유된 하플로타입과…
Functional genomics of human skeletal development and the patterning of height heritability
인체 골격 발달의 기능적 유전체학과 키 유전성의 패턴 분석 Abstract 키의 변이는 긴뼈 성장판을 구성하는 연골세포 (연골모세포)의 조절 변화에 기인합니다. 현재까지 우리는 인체 골격에서 채취한 연골모세포의 후성유전학적 조절과 유전자 발현에…
Bronze Age cheese reveals human-Lactobacillus interactions over evolutionary history
청동기 시대 치즈에서 드러난 인간-Lactobacillus 상호작용의 진화 역사 Abstract 발효 유제품 섭취의 오랜 역사에도 불구하고, 발효 미생물이 인류 역사 동안 어떻게 사용되고 진화했는지에 대해서는 거의 알려져 있지 않습니다. 이 연구에서는…
Recurrent evolution and selection shape structural diversity at the amylase locus
Amylase 유전자좌에서 재발생하는 진화와 선택에 의한 구조적 다양성 형성 Abstract 농업의 채택은 인간 집단에서 녹말이 풍부한 식단으로의 급격한 전환을 초래했습니다. Amylase 유전자는 녹말 소화를 돕는데, 녹말 섭취량이 많은 현대 인구…
Rapid DNA unwinding accelerates genome editing by engineered CRISPR-Cas9
신속한 DNA unwinding은 engineering된 CRISPR-Cas9에 의한 유전체 편집을 가속화한다 Abstract Thermostable clustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPR) 및 CRISPR-associated (Cas9) enzyme은 긴 단백질 수명으로 인해 유전체 편집 효율성과 전달…
Paternal microbiome perturbations impact offspring fitness
Paternal microbiome perturbations이 자손의 건강에 미치는 영향 Abstract gut microbiota는 host–environment interaction의 인터페이스에 작용하여 인체 항상성 및 대사 네트워크에 영향을 미칩니다. 따라서 gut microbial ecosystems의 불균형을 초래하는 환경적 요인은 신체…
Ancestral allele of DNA polymerase gamma modifies antiviral tolerance
DNA polymerase gamma의 Ancestral allele가 antiviral tolerance를 수정합니다. Abstract Mitochondria는 infection 후 mitochondrial RNA 및 DNA(mtDNA 및 mtRNA) 조각을 cytoplasm으로 방출하여 virus sensors와 type-I interferon (IFN-I) 반응을 활성화함으로써 antiviral tolerance를…
The variation and evolution of complete human centromeres
complete human centromeres의 변화와 진화 Abstract Human centromeres는 repetitive nature와 large size로 인해 염기서열을 분석하고 조립하기가 매우 어려웠습니다. 그 결과, human centromeric variation의 패턴과 진화와 기능에 대한 모델은 여전히 불완전하지만,…
(A) (좌측) 실험의 개요도. (우측) scRNA-seq은 uniform manifold approximation and projection (UMAP)을 통해 약 143,000개의 세포로 표시된 발달 과정의 인간 심장을 만드는 다양한 범위의 독특한 심장 세포를 식별함.
(B) MERFISH를 사용하여 238개의 심장 세포 특이 유전자가 공간적으로 어떻게 식별되었는지 보여주는 개략도. 각 색상은 10가지 특정 RNA 전사체의 개별 분자 위치를 표시.
(C) MERFISH로 식별된 약 250,000개의 심장 세포들이 UMAP에 의해 특정 세포 집단으로 군집화. 군집화 결과는 (D)에서 실제 심장 절단면에 세포 분포를 나타내기 위해 사용됨.
(D) (좌측) 식별된 MERFISH 세포들이 13주차 심장의 전면 절단면에 공간적으로 매핑되었으며, (우측) 주요 세포 클래스에 따라 표시.
(E) MERFISH와 age-matched scRNA-seq 데이터 세트 간의 joint embedding을 통해 세포 라벨 transfer과 MERFISH 유전자 추정이 가능해짐.
(F) Co-occurrence heatmap은 MERFISH 세포의 cell annotation과 13주차 scRNA-seq 데이터 세트에서 transfer된 annotation의 correspondence를 보여줌.
(G) 유전자 추정 성능은 MERFISH로 측정된 마커 유전자의 normalized gene expression profile과 해당 cell의 추정 gene expression profile을 공간적으로 비교함으로써 검증.
Spatially organized cellular communities form the developing human heart
공간적으로 조직된 세포 커뮤니티가 발생 단계의 인간 심장을 형성한다 Abstract 심장은 첫 번째로 발달하는 기관으로, 그 형태에 따라 기능이 크게 좌우된다. 하지만, 다양한 심장 세포 유형이 어떻게 공간적으로 조정되어 심장…