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Highlights • Drug-naive human melanomas contain cancer cells in a MES state • Melanoma cells in the MES state are enriched in on-treatment lesions refractory to ICB • TCF4 promotes the MES while suppressing the melanocytic and antigen presentation programs • Targeting TCF4 expression increases sensitivity to ICB and targeted therapy

A TCF4-dependent gene regulatory network confers resistance to immunotherapy in melanoma

*면역 체크포인트 차단제(immune checkpoint blockade, ICB)에 대한 내재적 저항성을 더 잘 이해하기 위해, 우리는 치료받지 않은 melanoma 생태계의 세포 구조에 대한 포괄적인 관점을 확립하고 ICB를 투여했을 때 어떻게 진화하는지 연구했다. 단일 세포, 공간 다중 오믹스(single-cell, spatial multi-omics)를 사용하여, 우리는 **종양 미세환경(tumor microenvironment, TME)이 복잡한 melanoma transcriptomic landscape의 출현을 촉진한다는 것을 보여주었다. ***중간엽 유사(mesenchymal-like, MES) 상태를 가진 melanoma 세포, 즉 표적 치료에 대한 저항성을 부여하는 것으로 알려진 세포군은 ICB에 반응하지 않는 환자들의 초기 치료 생검에서 상당히 풍부하게 발견되었다. TCF4는 이 landscape의 허브로서 MES signature의 주요 조절자(master regulator)이자 멜라노사이트(melanocytic) 및 항원 제시(antigen presentation) transcriptional program의 억제제 역할을 한다. 유전적으로나 약물학적(bromodomain 억제제 사용)으로 TCF4를 표적하는 것은 MES 세포의 면역원성과 ICB 및 표적 치료에 대한 민감도를 증가시켰다. 따라서, 우리는 여러 transcriptional program을 조정하고 melanoma에서 표적 치료와 ICB에 대한 저항성에 기여하는 TCF4 의존적 규제 네트워크를 밝혀냈다.

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Structural evolution of fibril polymorphs during amyloid assembly

amyloid assembly 중 fibril polymorphs의 Structural evolution. Abstract Cryoelectron microscopy (cryo-EM)은 질병과 관련된 amyloid fibril structures에 대한 전례 없는 통찰력을 제공했습니다. 이러한 구조는 긴 assembly processes의 endpoints를 나타내며, assembly 초기에…

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SPLASH: A statistical, reference-free genomic algorithm unifies biological discovery

SPLASH: 생물학적 발견을 통합하는 통계적이고 참조 없는 유전적 알고리즘 Abstract 현재의 유전체 분석 워크플로우는 대체로 참조 서열과의 정렬(alignment)을 필요로 하며, 이는 발견을 제한합니다. 우리는 통합적인 패러다임인 SPLASH (Statistically Primary aLignment…

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Germinal centers output clonally diverse plasma cell populations expressing high- and low-affinity antibodies

Germinal centers는 high- and low-affinity antibodies를 발현하는 다양한 plasma cell 집단을 clonally하게 생산합니다. Abstract Germinal centers (GC)는 immunization or infection 후 lymph nodes에 형성되어 antibody affinity maturation과 memory 및 plasma…

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Influence of autozygosity on common disease risk across the phenotypic spectrum

다양한 표현형에서 자가합일성이 common disease risk에 미치는 영향 Abstract 자가합일성(Autozygosity)* 는 rare Mendelian disorders와 연관된 임상적으로 의미있는 quantitative traits입니다. 우리는 유전체의 일부에서 동일 합일성** (FROH)의 비율과 common disease 간의 연관성을…

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Read more about the article Synthetic Par polarity induces cytoskeleton asymmetry in unpolarized mammalian cells

Synthetic Par polarity induces cytoskeleton asymmetry in unpolarized mammalian cells

Synthetic Par polarity는 unpolarized mammalian cells에서 cytoskeleton asymmetry를 유도합니다. Abstract Polarized cells은 polarized cytoskeleton에 의존하여 기능합니다. 그러나 cortical polarity cues가 어떻게 cytoskeleton polarization을 유도하는지는 여전히 밝혀지지 않았습니다. 여기서 우리는 최근에…

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Read more about the article Systemic immune profiling of Omicron-infected subjects inoculated with different doses of inactivated virus vaccine

Systemic immune profiling of Omicron-infected subjects inoculated with different doses of inactivated virus vaccine

다양한 용량의 불활성화 바이러스 백신을 접종한 Omicron 감염자의 전신 면역 프로파일링 Abstract SARS-CoV-2 *1차 균주 (primary strain) 기반 백신 접종은 부스터 접종을 통해 Omicron 변종으로 인한 감염, 증상 발생 및…

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Read more about the article Neuronal DNA double-strand breaks lead to genome structural variations and 3D genome disruption in neurodegeneration

Neuronal DNA double-strand breaks lead to genome structural variations and 3D genome disruption in neurodegeneration

Neuronal DNA double-strand breaks neurodegeneration에서 genome structural variations과 3D genome disruption로 이어집니다. Abstract neurons의 Persistent DNA double-strand breaks (DSBs)는 알츠하이머병(AD)을 포함한 neurodegenerative diseases의 early pathological hallmark로, genome integrity를 방해할 수…

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Read more about the article An antibiotic from an uncultured bacterium binds to an immutable target

An antibiotic from an uncultured bacterium binds to an immutable target

uncultured bacterium의 antibiotic의 immutable target에 결합합니다. Abstract Antimicrobial resistance는 전 세계적으로 주요 사망 요인중 하나입니다.여기에서는 uncultured soil bacteria에서 분리한 antibiotic인 clovibactin의 발견을 보고합니다. clovibactin은 drug-resistant Gram-positive bacterial pathogens을 detectable resistance…

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Cooperative assembly confers regulatory specificity and long-term genetic circuit stability

Cooperative assembly로 regulatory specificity와 long-term genetic circuit stability 제공 Abstract eukaryotic transcriptional regulation의 보편적인 특징은 transcription factors (TF)와 DNA cis-regulatory motifs 간의 cooperative self-assembly입니다. 이 전략은 상호 작용이 약하고 특이성이…

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