The temperature sensor TWA1 is required for thermotolerance in Arabidopsis
Arabidopsis의 내열성에 필요한 온도 센서 TWA1 Abstract 과도한 온도에 노출된 식물은 생리적 도전에 대처하고 장기적인 적응을 촉진하기 위해 열 스트레스 반응을 활성화합니다. 그러나 세포 온도를 감지하여 내열성을 유도하는 메커니즘은 아직…
Paternal microbiome perturbations impact offspring fitness
Paternal microbiome perturbations이 자손의 건강에 미치는 영향 Abstract gut microbiota는 host–environment interaction의 인터페이스에 작용하여 인체 항상성 및 대사 네트워크에 영향을 미칩니다. 따라서 gut microbial ecosystems의 불균형을 초래하는 환경적 요인은 신체…
Whole-cortex in situ sequencing reveals input-dependent area identity
전체 대뇌 피질 in situ sequencing으로 밝혀낸 입력 의존적 영역 정체성 Abstract 대뇌 피질은 다양한 유전자 발현을 가진 뉴런 유형으로 이루어져 있으며, 이들은 각기 다른 특징을 가진 피질 영역에 조직되어…
Refining the impact of genetic evidence on clinical success
임상 성공에 대한 유전적 증거의 영향 정제 Abstract 약물 개발의 비용은 주로 실패에 의해 좌우되며, 임상 프로그램 중 약 10%만이 승인을 받는 것으로 나타났습니다. 이전 연구에서는 인간 유전학적 증거가 임상…
First-in-class MKK4 inhibitors enhance liver regeneration and prevent liver failure
최초의 MKK4억제제는 간 재생을 향진 시키며 간 부전을 예방한다 Abstract 간 질환은 전 세계적으로 연간 200만 명 이상의 사망을 초래하는 대표적인 질환입니다. 급성 혹은 만성으로 손상된 간은 무한한 재생 잠재성을…
Immune microniches shape intestinal Treg function
면역 미세 환경이 장 내 Treg 기능을 조절한다. Abstract 장의 면역 시스템은 공생 미생물과 자가 항원에 대한 내성을 유지하면서 침입하는 병원체로부터 방어할 수 있도록 매우 적응되어 있다. 장의 복잡한 면역…
DNA glycosylases provide antiviral defence in prokaryotes
박테리아의 DNA 글리코실라아제인 Brig1이 변형된 바이러스 DNA 염기를 제거하여 박테리오파지 T4의 복제를 억제함으로써 바이러스에 대항하는 새로운 방어 기작을 발견하였습니다. Abstract 박테리아는 다양한 방어 시스템을 진화시키며 파지 포식에 적응해왔습니다. 비록 생물정보학…
Structural basis of Integrator-dependent RNA polymerase II termination
Integrator에 의존하는 RNA polymerase II termination의 구조적 기반 Abstract Integrator 복합체는 유전자의 프로모터 근처 영역에서 RNA polymerase II (Pol II)를 termination할 수 있습니다. 이전 연구에서 Integrator가 Pol II, DRB sensitivity-inducing…
Metabolic trade-offs constrain the cell size ratio in a nitrogen-fixing symbiosis
Metabolic trade-offs는 nitrogen-fixing symbiosis에서 cell size ratio를 제한합니다. Abstract Biological dinitrogen (N2) fixation은 prokaryotes이 독점적으로 수행하는 key metabolic process이며, 그중 일부는 eukaryotes과 공생합니다. marine haptophyte algae인 Braarudosphaera bigelowii Species는 N2-fixing…
(A) (좌측) 실험의 개요도. (우측) scRNA-seq은 uniform manifold approximation and projection (UMAP)을 통해 약 143,000개의 세포로 표시된 발달 과정의 인간 심장을 만드는 다양한 범위의 독특한 심장 세포를 식별함.
(B) MERFISH를 사용하여 238개의 심장 세포 특이 유전자가 공간적으로 어떻게 식별되었는지 보여주는 개략도. 각 색상은 10가지 특정 RNA 전사체의 개별 분자 위치를 표시.
(C) MERFISH로 식별된 약 250,000개의 심장 세포들이 UMAP에 의해 특정 세포 집단으로 군집화. 군집화 결과는 (D)에서 실제 심장 절단면에 세포 분포를 나타내기 위해 사용됨.
(D) (좌측) 식별된 MERFISH 세포들이 13주차 심장의 전면 절단면에 공간적으로 매핑되었으며, (우측) 주요 세포 클래스에 따라 표시.
(E) MERFISH와 age-matched scRNA-seq 데이터 세트 간의 joint embedding을 통해 세포 라벨 transfer과 MERFISH 유전자 추정이 가능해짐.
(F) Co-occurrence heatmap은 MERFISH 세포의 cell annotation과 13주차 scRNA-seq 데이터 세트에서 transfer된 annotation의 correspondence를 보여줌.
(G) 유전자 추정 성능은 MERFISH로 측정된 마커 유전자의 normalized gene expression profile과 해당 cell의 추정 gene expression profile을 공간적으로 비교함으로써 검증.
Spatially organized cellular communities form the developing human heart
공간적으로 조직된 세포 커뮤니티가 발생 단계의 인간 심장을 형성한다 Abstract 심장은 첫 번째로 발달하는 기관으로, 그 형태에 따라 기능이 크게 좌우된다. 하지만, 다양한 심장 세포 유형이 어떻게 공간적으로 조정되어 심장…