Host genetic regulation of human gut microbial structural variation

인간 유전자가 장내 미생물 구조 변이를 조절하는 방법 Abstract 인간 유전자가 장내 미생물 다양성 및 특정 분류군의 풍부성에 미치는 영향은 이미 잘 알려져 있지만, 인간 유전자가 장내 미생물의 유전적 다양성을…

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Read more about the article A new antibiotic traps lipopolysaccharide in its intermembrane transporter
Gram-negative 박테리아의 세포질 막은 외부 막에 의해 둘러싸여 있는데, 이 외부 막은 대부분의 항생제의 진입을 막아서 박테리아를 죽이기 어렵게 만든다. 외부 막에 침투할 수 없는 이유는 외층에 큰 amphipathic glycolipid인 lipopolysaccharide(LPS)가 존재하기 때문이다. 외부 막의 조립은 LPS를 세포질 막에서 세포 표면까지 transport하는 protein bridge를 통해 이루어진다. 외부 막의 무결성을 유지하는 것은 박테리아 세포의 생존에 필수적이고, 이를 파괴한다면 다른 항생제에 대한 감수성을 증가시킬 수 있다. 따라서, 이 transport 과정을 구성하는 7개의 Lpt 단백질을 억제하는 것이 오랫동안 연구되어 왔다. 최근 Acinetobacter에서 LPS transport machinery를 대상으로 하는 새로운 클래스의 항생제가 확인되었다. 여기에서, 우리는 구조적, 생화학적, 유전적 접근법을 사용하여 이 항생제들이 LPS transporter에 결합된 substrate-bound conformation을 가둬 이 machinery를 정지시킨다는 것을 보여준다. 이는 억제제들이 Lpt transporter와 그 LPS substrate로 구성된 복합 결합 사이트를 인식함으로써 달성된다. 우리의 발견은 lipid transport inhibition의 특이한 메커니즘을 식별하고, Lpt transporter의 약물화 가능한 conformation을 드러내며, 이 클래스의 항생제를 다른 gram-negative pathogen에 확장하는 기초를 제공한다.

A new antibiotic traps lipopolysaccharide in its intermembrane transporter

LPS를 세포막 간 transporter에 가두는 새로운 항생제 Abstract Gram-negative 박테리아의 세포질 막은 외부 막에 의해 둘러싸여 있는데, 이 외부 막은 대부분의 항생제의 진입을 막아서 박테리아를 죽이기 어렵게 만든다. 외부 막에…

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Read more about the article The selection landscape and genetic legacy of ancient Eurasians
*홀로세(Holocene)는 인간 진화에서 가장 중요한 변화를 포함하고 있으며, 현대 인구의 식단, 신체 및 정신 건강에 광범위한 영향을 미친 시기이다. 우리는 1,600개 이상의 추정된 고대genomes 데이터셋을 사용하여, 서부 유라시아에서 수렵과 채집에서 농업과 목축으로의 전환 동안의 selection landscape을 모델링했다. 우리는 대사와 관련된 주요 selection signal들을 식별했는데, 이는 FADS cluster에서의 선택이 이전에 보고된 것보다 더 일찍 시작되었으며, LCT locus 근처에서의 선택이 lactase persistence allele의 출현보다 수천 년 앞서 있다는 것을 포함한다. 우리는 또한 **청동기 시대(Bronze Age) 동안 병원체에 대한 노출 증가로 인해 HLA 영역에서 강한 선택을 찾았다. UK Biobank의 400,000개 이상의 샘플에서 고대 개인을 사용하여 지역 ancestry tracts를 추론함으로써, 우리는 유라시아 전역에서 중석기 시대(Mesolithic), 신석기 시대(Neolithic), 청동기 시대 ancestries의 분포에 널리 퍼진 차이점을 식별한다. 우리는 Ancestry-specific polygenic risk scores를 계산함으로써, 1) Northern과 Southern Europe 사이의 키 차이가 selection에 의한 것이 아니라 ***** Steppe ancestry 차이와 연관됐고, 2) 기분 관련 표현형에 대한 risk alleles는 신석기 시대 농경 ancestry에 풍부하며, 3) 당뇨병과 알츠하이머 질병에 대한 risk alleles는 서구의 수렵-채집 ancestry에 풍부하다는 것을 보여준다. 우리의 결과는 고대 selection과 이동이 현대 유럽인의 표현형 다양성 분포에 큰 기여를 했다는 것을 나타낸다.

The selection landscape and genetic legacy of ancient Eurasians

고대 유라시안의 selection landscape와 유전적 유산 Abstract *홀로세(Holocene)는 인간 진화에서 가장 중요한 변화를 포함하고 있으며, 현대 인구의 식단, 신체 및 정신 건강에 광범위한 영향을 미친 시기이다. 우리는 1,600개 이상의 추정된…

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Single-cell DNA Methylome and 3D Multi-omic Atlas of the Adult Mouse Brain

성체 생쥐 뇌의 Single-cell DNA 메틸옴 및 3D 다중-오믹스 아틀라스 Abstract Cytosine DNA 메틸화는 뇌 발달에 필수적이며 다양한 신경학적 장애와 관련이 있습니다. 전체 뇌에서 DNA 메틸화 다양성을 공간적 맥락에서 이해하는…

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Organ aging signatures in the plasma proteome track health and disease

혈장 프로테옴에서의 장기 노화 signature이 건강과 질병에 대한 정보를 제공합니다 Abstract 동물 연구에 따르면 개체 및 개체의 장기마다 노화가 다르게 나타난다고 합니다[1-4]. 하지만 이 현상이 인간에게도 해당되는지, 그리고 이것이 연령…

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Bioactive glycans in a microbiome-directed food for children with malnutrition

영양실조 어린이를 위한 마이크로바이옴 지향 식품에서의 생물활성 다당류 Abstract 최근의 증거에 따르면, 출생 후 장내 미생물군의 발달 장애가 어린이의 영양실조에 기여할 수 있다는 것이 밝혀지고 있다. 본 연구에서는 *마이크로바이옴 지향…

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A high-resolution transcriptomic and spatial atlas of cell types in the whole mouse brain

전체 mouse brain의 세포 유형에 대한 고해상도 transcriptomic과 spatial atlas Abstract 성인 쥐 뇌는 수백만에서 수십억 개의 세포로 구성되어 있으며, 이들은 특정한 spatial 분포 패턴과 구조적, 기능적 특성을 가진 많은…

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Influence of autozygosity on common disease risk across the phenotypic spectrum

다양한 표현형에서 자가합일성이 common disease risk에 미치는 영향 Abstract 자가합일성(Autozygosity)* 는 rare Mendelian disorders와 연관된 임상적으로 의미있는 quantitative traits입니다. 우리는 유전체의 일부에서 동일 합일성** (FROH)의 비율과 common disease 간의 연관성을…

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Clinical trial links oncolytic immunoactivation to survival in glioblastoma

교모세포종(glioblastoma) 생존율과 연결된 온콜리틱(oncolytic) 면역 활성화*에 관한 임상 시험 Abstract 면역 요법 실패는 재발성 교모세포종(rGBM)과 같은 공격적인 형태의 암을 특징짓는 매우 억제적인 종양 미세환경에서 비롯될 수 있습니다. 여기서 우리는 재발성…

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Deconstruction of rheumatoid arthritis synovium defines inflammatory subtypes

류마티스 관절염 *윤활막(synovium)의 세부 분석으로 염증성 subtype을 정의 Abstract 류마티스 관절염은 관절의 염증과 파괴를 일으키는 전형적인 자가면역 질환이다. 현재 류마티스 관절염에 대한 치료법은 없으며, 치료의 효과가 환자에 따라 다르다는 점에서…

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