prostate cancer의 African-specific molecular taxonomy
Prostate cancer(전립선암)은 상당한 geo-ethnic 불균형이 특징입니다. 아프리카 ancestry는 사하라 사막 이남 아프리카 전역의 사망률이 세계 평균보다 2.7배 높은 중요한 위험 요소입니다. 기여하는 유전적, 비유전적 요인 및 관련 돌연변이 과정은 알려져 있지 않습니다.
여기에서 183명의 조상(아프리카 대 유럽)과 전 세계적으로 구별되는 환자의 치료 경험이 없는 prostate cancer 샘플의 전체 게놈 시퀀싱을 통해 사하라 사막 이남 아프리카에 대한 대규모 암 게놈 리소스를 생성하여 약 2백만 개의 체세포 변이를 식별합니다.
아프리카 계통 특유의 중요한 발견에는 종양 tumor mutational burden, genome alteration 비율 증가, 예측되는 damaging mutations의 증가 및 total of mutational signatures 증가, driver genes NCOA2, STK19, DDX11L1, PCAT1 및 SETBP1이 포함됩니다. 모든 체세포 돌연변이 유형을 조사하여 우리는 조상에 의해 분화되고 global mutational subtypes (GMS)로 정의된 prostate cancer에 대한 molecular taxonomy를 설명합니다. 중국 아시아인 데이터를 추가로 포함함으로써 GMS-B(copy-number gain) 및 GMS-D(mutationally noisy)는 아프리카 인구에만 해당하고 GMS-A(mutationally quiet)는 보편적(all ethnicities)이며 아프리카– 유럽 restricted subtype GMS-C(copy-number losses)는 나쁜 임상 결과를 예측합니다. 아프리카 혈통의 개인을 포함하는 임상적 이점 외에도, 우리의 GMS subtypes는 공통 유전 및 환경 요인이 인종 간의 불균형에 기여한다는 것을 시사하는 다양한 진화 궤적과 돌연변이 과정을 보여줍니다.
유전자-환경 상호작용(여기서 다른 조상을 가진 사람들 또는 그 반대의 환경 환경의 다른 효과로 정의됨)과 유사하게, 우리는 GMS subtypes이 암의 intrinsic과 extrinsic 돌연변이 과정에 대한 대리인 역할을 하여 획기적인 연구에 글로벌 포함을 촉진할 것으로 예상합니다.