Membrane-traversing macrocycles의 정확하고 새로운 설계
Macrocycle의 막투과성과 oral bioavailability를 체계적으로 정립하기 위해 실험적 특성과 연결된 computational design을 사용합니다. 우리는 noncanonical backbone modification과 실험적으로 결정된 35개의 구조를 포함하는 광범위한 예측 구조를 가진 184개의 6-12개 잔기 macrocycle을 설계했습니다. 그 중 29는 계산 모델에 매우 가깝습니다. 이러한 과정을 통해 우리는 모든 amide (NH) 그룹이 내부 수소 결합 상호작용에 관여하여 막투과성을 가지도록 할 수 있음을 보여줍니다. 6-12개 잔기의 범위에 걸친 84개의 디자인은 1 x 10-6 cm/s보다 큰 apparent permeability를 갖는 cross membrane을 사용합니다. 노출된 NH기가 있는 디자인은 지질 막에서 선호되는 alternative isoenergetic 수소 결합 상태의 디자인을 통해 막을 투과성으로 만들 수 있습니다. 높은 구조적 정확도로 막투과성과 oral bioavailability peptide를 설계하는 능력은 macrocycle 치료제의 차세대 설계에 기여할 것입니다.