cryptic plasmid는 인간의 장에서 가장 많은 genetic elements 중 하나입니다.
Abstract
플라스미드는 종종 fitness-enhancing features를 암호화하는 extrachromosomal genetic elements입니다. 그러나 많은 박테리아는 명확하게 유익한 기능을 부여하지 않는 ” cryptic” 플라스미드를 가지고 있습니다.
우리는 산업화된 gut microbiomes에서 어디에나 존재하며 현재 인간 장내에서 가장 풍부한 extrachromosomal genetic element로 확립된 crAssphage보다 14배나 많은 cryptic plasmid 중 하나인 pBI143을 확인했습니다. pBI143의 돌연변이 대부분은 수천 개의 metagenomes에 걸쳐 특정 위치에 축적되어 강력한 purifying selection을 나타냅니다. pBI143은 대부분의 개인에서 monoclonal이며, 이는 종종 어머니로부터 처음 획득한 버전의 priority effect 때문일 수 있습니다. pBI143은 Bacteroidales 간에 이동할 수 있으며 in vivo bacterial host fitness에 영향을 미치지는 않지만 일시적으로 additional genetic content를 획득할 수 있습니다.
우리는 인간의 fecal contamination을 식별하는 데 사용하고 인간의 대장 염증 상태를 추적하는 대안적 접근법으로서의 잠재력을 포함하여 pBI143의 중요한 실제 응용 분야를 확인했습니다.