Nuclear genetic control of mtDNA copy number and heteroplasmy in humans

인간의 mtDNA copy number와 heteroplasmy의 Nuclear genetic control.

Nuclear genetic control of mtDNA copy number and heteroplasmy in humans

Abstract

Mitochondrial DNA(mtDNA)는 oxidative phosphorylation에 필요한 모계로부터 유전되는 high-copy-number genome입니다. Heteroplasmy는 한 개인에게 mtDNA alleles가 혼합되어 있는 것을 말하며 질병 및 ageing과 관련이 있습니다. human heteroplasmy의 일반적인 variation의 기저에 있는 메커니즘과 이러한 variation에 대한 nuclear genome의 영향은 아직 충분히 밝혀지지 않았습니다.

여기서는 274,832명의 blood-derived whole-genome sequences를 사용하여 mtDNA copy number (mtCN)와 heteroplasmy를 정량화하고 genome-wide association studies를 수행하여 관련 nuclear loci를 식별합니다. blood cell composition correction 후, mtCN은 나이에 따라 선형적으로 감소하며 92개 nuclear loci의 variants와 연관되어 있음을 발견했습니다. 거의 모든 사람이 두 가지 원칙을 따르는 heteroplasmic mtDNA variants를 보유하고 있음을 관찰했습니다: (1) heteroplasmic single nucleotide variants는 체세포에서 발생하여 70세 이후에 급격히 축적되는 경향이 있는 반면, (2) heteroplasmic indels은 mtDNA 복제, 유지 및 새로운 경로에 관여하는 42개 nuclear loci와 관련된 상대적 수준의 혼합물로 모계로 유전됩니다. 이러한 loci는 특정 mtDNA alleles에 replicative advantage를 부여하는 방식으로 작용할 수 있습니다. 예를 들어, 우리는 이전에 mtDNA transcription/replication switching을 매개하는 것으로 제안된 G-quadruplex 내 chrM:302 위치에서 인간의 50% 이상이 가지고 있는 length variant를 확인했습니다. 우리는 이 variant가 mtDNA abundance에 대한 cis-acting genetic control을 발휘하며, 그 자체가 이 regulatory switch에 대한 nuclear loci encoding machinery과 in-trans 관련되어 있다는 것을 발견했습니다.

우리의 연구는 nuclear genome의 일반적인 variation이 인간 집단 전반에 걸쳐 mtCN의 variation과 heteroplasmy dynamics를 형성할 수 있음을 시사합니다.

 

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