Viroid 및 viroid-like covalently closed circular(ccc) RNA는 일반적으로 단백질을 암호화하지 않고 복제를 위해 세포 효소를 hijack는 최소한의 복제자입니다. 그러나 viroid-like 물질의 범위와 다양성에 대한 이해는 아직 부족합니다.

이 연구에서는 viroid-like cccRNA를 식별하기 위한 계산 파이프라인을 개발하여 5,131개의 metatranscriptome와 1,344개의 식물 transcriptome에 적용했다. 이번 연구에서는 4,409종 수준의 집단에 걸쳐 11,378개의 viroid-like cccRNA가 발견되었는데, 이는 이전에 확인된 viroid-like elements에 비해 5배 증가한 것입니다. 이 다양한 컬렉션 내에서 연구진들은 수많은 putative viroids, satellite RNA, retrozyme 및 ribozy-like virus들을 발견했습니다. cccRNA 내에서는 다양한 ribozyme 조합과 특이한 ribozyme이 확인되었습니다. Self-cleaving ribozyme은 ambivirus, 일부 mito-like virus 및 capsid-encoding satellite virus-like cccRNA에서 확인되었습니다.

다양한 전사체와 생태계에서 viroid와 같은 cccRNA의 광범위한 존재는 그들의 숙주 범위가 현재 알려진 것보다 훨씬 넓다는 것을 의미하며, CRISPR spacer와 일치하는 것은 일부 cccRNA가 원핵생물에서 복제된다는 사실을 시사합니다.